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基因组学_分子生物学练习

时间:2020-02-09百科知识联系我们
基因组学_分子生物学练习

二十三、基因组学

1.什么是开放阅读框(ORF)?请写出含有一段短的开放阅读框的DNA序列。

2.什么是YAC载体的基本元件?

3.BAC是以哪种质粒为基础而构建的?哪些元件是BAC所必需的?

4.比较大基因组的克隆-克隆测序策略和鸟枪法测序策略。

5.简述在基因组中寻找STS序列的步骤。

6.什么是微卫星DNA和小卫星DNA?为什么在绘制连锁遗传图谱时微卫星DNA比小卫星DNA更适用?

7.怎样运用一套BAC克隆中的STSs来构建一个毗连群www.jj11jj.com,请用不同于教材中的示意图进行说明。

8.怎样运用放射性杂交图谱对STSs进行作图。

9.表达序列标签(EST)与普通的STS有何不同?

10.从人类第22号染色体的序列可以得出哪些主要结论?

11.从人类第21号染色体的序列可以得出哪些主要结论?

12.比较“结构基因组”和“功能基因组”。

13.如何制备DNA芯片(寡核苷酸阵列)?

14.制备一个DNA芯片,要求其中两点中含有二核苷酸AC和AT,试说明制备步骤(可以忽略其他的点)。

15.设计一个实验:要求应用DNA微阵列或者DNA芯片来衡量在病毒感染细胞的两个阶段中病毒基因的转录情况,并说明范例结果。

16.怎样用一个SAGE实验来检测某种类型癌细胞的转录情况。请说明双标产物在此实验中的作用,并给出在此实验中所用的序列。

17.通过外显子陷阱(exontrap)能否检测到以下的DNA片段,为什么?(a)内含子(b)外显子的一部分(c)一个完整外显子,在两端有部分内含子(d)一个完整外显子,在一端有部分内含子

18.列举三种在megaYAC克隆中检测某个基因的方法。(www.anred.net.cn)

19.(1)哪种突变引起了亨廷顿综合征?

(2)什么证据证明HD基因的突变导致亨廷顿综合征?

20.以下是通过RFLP方法对某一区域进行分析后得出的物理图谱。有数字标注的垂直线表www.jj11jj.com示SmaI酶切位点,在2和3处(带圆圈)具有多态性的,1和4则不具有多态性。这段DNA经SmaI酶切后所产生的片段经电泳分离后转移到膜上,再与DNA探针(其大小及位置如图所示)进行杂交。根据下表中的信息,写出在各个单模标本所检测到的带的大小。

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21.对某种遗传疾病的基因进行作图,发现该基因与RFLP中的一个名为X-21的探针连锁,用标记的X-21探针与一组人鼠杂交细胞的DNA进行杂交。下面是杂交结果,并显示了A~F组的杂交细胞含有的人染色体。请问是哪条人染色体含有该基因?

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22.(1)哪种CF突变在囊肿性纤维化www.jj11jj.com中最为普遍?

(2)有哪些证据证明编码CFTR的基因确实是CF?

23.什么是SNPs(单核苷酸多态性)?为什么绝大多数SNPs并不重要,只有少数有用?

24.请比较转录组学与蛋白质组学中所用技术及所含信息的异同。

参考书:

1.RobertF,Weaver.Molecular,Biology(SecondEdition)

2.GeorgeM,Mwww.jj11jj.comalacinski,DavidFreifelder.EssentialofMolecularBiology(影印版).科学出版社

3.Lodish,Berk,Zipursky,Matsudaira,Baltimore,Darnell.MolecularcellBiology(FourthEdition)

4.郜金荣,叶林柏.分子生物学(第二版).武汉大学出版社